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摘要
目的 通过生物信息学分析，探索肝癌的异常表达基因及其与肝癌预后的关系。方法 从GEO数据库中选择肝癌相关的5个数据集，探索差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs），再进一步进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。选择共上调的基因CNIH4及TOMM40，探索其在肝癌组织和正常组织中的表达差异，并探索其表达与患者总体生存的关系。同时收集广东省第二人民医院的8例肝癌组织及其癌旁组织，验证CNIH4及TOMM40 mRNA的表达差异。结果 本研究发现共上调基因25个，共下调基因21个。GO分析和KEGG分析结果示DEGs主要与分解代谢、细胞分裂、DNA复制、修复等有关。TCGA数据库分析结果表明，CNIH4 mRNA和TOMM40L mRNA在肝癌组织中的表达相较于正常组织上调（P<0.05），并且高表达组患者的预后较低表达组更差（P<0.05）。临床样本结果表明，CNIH4 mRNA和TOMM40L mRNA在肝癌组织中的表达较癌旁组织上调。结论 CNIH4、TOMM40L基因在肝癌组织中表达上调，且其高表达与不良预后相关，可能是肝癌潜在的生物标志物及预后指标。
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