高温胁迫香葱内参基因筛选与稳定表达分析

作者:郭元元; 蒋月喜; 车江旅; 张力; 陈琴; 宋焕忠; 李洋; 秦龙妹; 甘立; 陈振东
来源:分子植物育种, 2021, 1-27.

摘要

香葱(Allium fistulosum L. var. Caespitosum Makino)响应高温胁迫过程中,差异表达基因的鉴定及表达验证对深入了解香葱的高温应答分子响应机理具有重要意义。为筛选高温胁迫下香葱稳定表达的内参基因,本研究以香葱耐热品种AF60和不耐热品种AF35的叶片为材料,分别进行高温胁迫不同时间处理,选取13个候选内参基因(Ac18S, Af18s, Af28s, AcActin, AfActin, AfTUA, AfTUB, AsSAND, AfMYH, AfGAPDH, AfUBQ, AfEF1α, AfCYC),利用实时荧光定量RT-qPCR技术检测香葱高温胁迫处理候选内参基因的表达,采用GeNorm、NormFinder、BestKeeper软件评价其稳定性,并进行综合分析。结果表明:13个内参基因在不同高温处理下的表达稳定性存在差异,综合分析香葱内参AfActin表达最稳定,其次为AfEF1α、Af28s;而AcActin表达最不稳定;同时,结果显示利用香葱转录组开发的内参基因普遍稳定性高于葱属其他作物开发的内参。该结果为香葱基因的表达分析提供了可供选择的内参基因。