芽孢杆菌subtilis str Sec分泌蛋白预测分析

作者：张路路; 朱德全; 张跃华; 白雪; 韩诚武

来源：中国科技信息, 2018, (19): 98-99.

• 枯草芽孢杆菌
• 功能分析
• 分泌途径
• 分泌蛋白
• subtilis str Sec
• 信号肽
• COG
• 预测分析

<正>本文针对枯草芽孢杆菌Subtilis str. 168的Sec分泌途径Spase Ⅰ类和Ⅱ类蛋白进行预测和分析,有助于了解该菌与宿主之间的作用机制,为该菌的筛选和应用打下了基础,也丰富了基因组序列和原核生物数据库。枯草芽孢杆菌是一类广泛存在植物和土壤中的具有较强抗逆性的革兰氏阳性益生菌,具有繁殖快,能抑制有害菌的生长等特点,是研究菌种的典型菌株。蛋白的Sec分泌途径的分析能够认识该菌株的生理功能和与宿主之间的作用机理。方法:Sec途径分泌蛋白具有Ⅰ型信号肽的分泌蛋白Spase Ⅰ和Ⅱ型信号肽的分泌蛋白Spase Ⅱ。首先在NCBI(w-

• 单位
  佳木斯大学; 生命科学学院