甘蓝型油菜GRAS家族基因SCARECROW-LIKE6 (BnSCL6)的克隆及序列分析

作者：王建伟; 贺晓岚^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-8.

• 油菜
• BnSCL6
• 基因克隆
• 序列分析

GRAS是植物特有的转录因子，SCL是GRAS家族的成员之一，参与植物生长发育、信号转导、解毒、生物和非生物胁迫相关的应答过程。为了挖掘和利用油菜的优良基因，拓宽作物非生物胁迫抗性基因资源，本研究利用PCR法从‘南油868’和‘美国油王88’油菜品种中扩增SCL6基因，并对其进行生物信息学分析。结果显示，2条SCL6全长序列(分别命名为BnSCL6-NY868和BnSCL6-MY88， GeneBank登录号为OP750509和OP750510)完全一致，为1 689 bp，编码由562个氨基酸组成的分子量为61.77 kD，理论等电点为5.79的亲水蛋白；亚细胞定位结果显示其编码蛋白主要定位于细胞核；保守结构域预测结果表明，BnSCL6属于GRAS家族成员；进化树分析结果表明，BnSCL6与NCBI中已公布的甘蓝型油菜scarecrow-like protein 6 (XP＿048595087)氨基酸序列相似性最高，为99.82%，与拟南芥转录因子GRAS (KAG7614591.1)的相似性为74.80%，与拟南芥scarecrow-like protein 6 (XP＿020878418.1)的相似性为73.24%，说明本研究克隆到的基因可能属于GRAS家族SCL亚家族。本研究为深入解析甘蓝型油菜BnSCL6的生物学功能、生长发育及非生物胁迫抗性调控的分子机理奠定了重要基础。

• 单位
  凯里学院