miR-124-3p调控的LAD1作为肺腺癌潜在治疗靶点的生物信息学分析

作者：孙百尔; 钱佳燕^*

来源：南通大学学报(医学版), 2023, 43(05): 406-411.

DOI：10.16424/j.cnki.cn32-1807/r.2023.05.002

• 非小细胞肺癌
• 差异表达基因
• ladinin-1
• 微小RNA-124-3p
• 生物信息学分析

目的 ：应用生物信息学探索非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)发病机制，筛选目标基因。方法：使用R语言limma包对基因表达综合数据库(gene expression omnibus, GEO)中NSCLC数据集进行差异表达基因鉴定，并对差异表达基因进行基因本体论(gene ontology, GO)分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析，然后通过STRING数据库和Cytoscape进行关键基因筛选，在Kaplan-Meier Plotter数据库对核心基因进行生存曲线分析，并对感兴趣的核心基因进行表达差异的验证，使用TargetScan数据库预测调控靶基因的微小RNA(microRNA, miRNA)。结果：共筛选出289个差异表达基因，蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选出10个核心基因，其中ladinin-1(LAD1)在蛋白印迹分析中表达差异明显，Kaplan-Meier Plotter数据库显示LAD1在肺腺癌组织中高表达与不良预后有关。TargetScan数据库预测调控靶基因的miR-124-3p与LAD1的mRNA的3′UTR结合。miR-124-3p在NSCLC组织中表达明显下调，且与女性肺腺癌患者的预后具有一定相关性。结论：miR-124-3p调控的LAD1可能是女性肺腺癌潜在的治疗靶点。

• 单位
  南通大学附属医院