2013-2015年中国冬油菜参试品种(系)DNA指纹数据库的初步构建及分析

作者：许鲲; 吴金峰; 李锋; 陈碧云; 高桂珍; 闫贵欣; 乔江伟; 黄邦全; 伍晓明

来源：中国油料作物学报, 2017, 39(02): 160-169.

• 冬油菜品种(系)
• 指纹库
• SSR荧光标记
• 毛细管电泳法

为了满足日益增长的冬油菜新品种鉴定需要,采用多色SSR荧光标记组合毛细管电泳检测法,构建了419份2013-2015年度国家冬油菜区域试验中的冬油菜新品种(系)×38对SSR荧光标记的DNA指纹数据库。所有标记共检测到41个位点,其中双位点标记3个,单位点标记35个。38个多态性SSR标记于419份冬油菜新品种中共检测到129个等位变异;每个位点的变异范围为2~6,平均每个位点3.15个。等位基因型数共250个,每个位点的基因型数为3~15个,平均每个位点6.09个。41个位点的多态性信息指数PIC值变幅为0.132 2~0.690 7,平均为0.390 2。统计指纹数据库缺失率为1.1%,具有较好的完整性。DICE相似系数矩阵分析得出,419份中国冬油菜新品种(系)间成对遗传相似系数共获取87 571个数据项,品种间遗传相似系数变幅为0.366~0.983,平均遗传相似系数为0.692。相似系数在区间0.601~0.800内共有78 571个数据项,占总数的89.72%。此结果一定程度表明冬油菜新品种(系)的遗传多样性不够丰富。

• 单位
  湖北大学; 中国农业科学院油料作物研究所; 农业部