甜菜组蛋白去乙酰化酶(HDACs)基因家族鉴定及功能预测

作者：王琳玉; 蒋依辰; 于清洋; 吴则东; 邳植^*

来源：中国农学通报, 2022, 38(08): 9-16.

• 甜菜
• 春化作用
• 组蛋白去乙酰化酶
• 基因家族
• 抽薹

为了鉴定甜菜基因组中春化作用相关的组蛋白去乙酰化酶(HDACs)。本研究利用HMMsearch和Blastp鉴定BvHDACs基因家族成员，并采用iqtree程序构建最大似然进化树。利用TBtools分析BvHDACs染色体定位、基因结构。通过转录组测序分析春化过程中BvHDACs表达模式。结果表明，甜菜共有16个的BvHDACs基因分别位于5条染色体。它们可分为RPD3/HDA1、SIR2、HD2三个亚家族，亚家族内各成员功能结构域高度相似。转录组测序表明多个RPD3/HDA1、SIR2和HD2成员在春化过程中发生显著变化。尤其是，BvHDT1和BvHDT2变化趋势与抽薹表型变化具有相关性。蛋白互作预测表明BvHDT1、BvHDT2具有与BvFLD、BvJMJ11、BvJMJ12等抽薹开花相关蛋白相互作用的潜力。综上，推测BvHDT1和BvHDT2可能参与甜菜春化作用。

• 单位
  黑龙江大学