青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析

作者：谢静敏; 侯万伟; 张小娟^*

来源：麦类作物学报, 2022, 42(11): 1343-1350.

• 青海省
• 小麦
• 55K SNP
• 遗传多样性

为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性，选取93个青海小麦品种，基于55K SNP芯片对其进行全基因组扫描，并进行遗传多样性分析。结果共扫描到53 063个SNP位点，选择分型成功率(call rate, CR)≥0.90、缺失率<10%、MAF>0.05的SNP位点，获得多态性SNP位点50 243个，多态性比率为94.68%。其中多态性位点在第2同源群中分布最多，在第4同源群中分布最少，在基因组中分布呈现B>A>D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少。93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00～0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点；两两品种间的遗传距离为0.00～0.67,平均值为0.41。通过聚类分析表明，根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群。综上，青海省现有小麦品种的遗传关系较近，需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性，推动小麦品种的选育及研究工作。

• 单位
  青海省农林科学院