国内部分地区PRRSV流行毒株变异情况分析

作者：吴瑕; 劳梦琴; 谭祥梅; 陈鹏飞; 于家荣; 张玉娇; 虞凌雪; 高飞; 童光志; 周艳君

来源：中国动物传染病学报, 2021, 1-16.

• PRRSV
• Nsp2
• ORF5
• 遗传变异

为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行毒株的遗传变异情况，本研究对采集自上海、浙江、江苏等地区的566份临床样品进行RT-PCR检测，结果显示，其中246份样品呈现PRRSV阳性。对31株Nsp2基因、21株ORF5基因和12株Nsp9基因进行序列测定和比对分析，发现不同地区流行的PRRSV其Nsp2基因片段大小存在明显差异，大部分毒株保持了HP-PRRSV类毒株Nsp2基因“1+29aa”缺失模式，同时，检测到“111+5+1+19 aa”和“1+29+14 aa”两种新的氨基酸缺失模式。ORF5基因主要分布在谱系L8、L3和L1中，氨基酸突变主要位于GP5的信号肽区域和高变区，其中有14株在中和性抗原表位存在L39I的突变。部分毒株在GP5与毒力相关的氨基酸位点出现了R13Q和R151K的突变，而Nsp9与毒力相关的氨基酸位点则相对保守。此外，本研究获得的HBap4和SHpd1的ORF5和Nsp2基因分别属于不同谱系，推测其可能存在基因重组。研究结果表明，上述发病猪场中PRRSV流行株主要以谱系L8的HP-PRRSV类毒株和L1的NADC30类毒株为主，而谱系L3的QYYZ类毒株也在猪群中流行，呈现出PRRSV流行的多样性，提示我们持续监测PRRSV流行毒株的变异动态的必要性。

• 单位
  中国农业科学院上海兽医研究所