基于高通量测序分析蟹糊微生物菌群多样性

作者：李成; 孔晓雪; 余炬波; 邹小欠; 罗海波^*

来源：食品科学, 2020, 41(04): 134-139.

• 蟹糊
• 高通量测序
• 菌群结构

为探索不同贮藏温度下蟹糊微生物菌群结构,应用Illumina MiSeq高通量测序技术研究蟹糊在-20℃和4℃贮藏3 d后的微生物菌群多样性。结果表明:-20℃贮藏3 d的蟹糊样品V1-V3和V3-V4区域扩增所得微生物菌属分别为18属和26属,4℃贮藏3 d的蟹糊样品V1-V3和V3-V4区域扩增所得微生物菌属分别为16属和19属。相对丰度大于1%的菌属为肉食杆菌属(Carnobacterium)、Jeotgalibaca、环丝菌属(Brochothrix)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、弧菌属(Vibrio)。-20℃贮藏3 d的蟹糊样品优势菌属为肉食杆菌属(V1-V3,68.81%;V3-V4,69.29%)和弧菌属(V1-V3,16.75%;V3-V4,14.39%)。4℃贮藏3 d的蟹糊样品优势菌属为肉食杆菌属(V1-V3,73.37%;V3-V4,70.35%)、Jeotgalibaca(V1-V3,11.82%;V3-V4,12.35%)和葡萄球菌属(V1-V3,5.45%;V3-V4,5.01%),同时Jeotgalibaca和葡萄球菌属相对丰度显著高于-20℃贮藏的蟹糊样品。以上结果表明,蟹糊在不同贮藏温度下菌群多样性、优势菌属及其相对丰度均存在显著差异(P<0.05)。本研究为有效预防腌制生食蟹糊食源性疾病的发生及控制技术的开发提供理论依据。

• 单位
  南京师范大学; 安徽科技学院