摘要
目的:通过挖掘生物信息数据库,探讨含TCP-1的伴侣蛋白(CCT)家族基因及CCT4基因在肺腺癌中的表达和预后分析。方法:从Linkedomics和UALCAN数据库收集肺腺癌中CCT家族基因的相关信息,分析其在肺腺癌及肺腺癌临床总分期和TNM分期中的表达情况,并分析其与肺腺癌预后的相关性;通过STRING数据库分析CCT4的相关蛋白,并对CCT4及其相关蛋白进行富集分析。结果:CCT2/3/4/5/6A/6P1/7/8的表达与肺腺癌预后呈相关关系(P<0.05),CCT2/4/5/6A/6B/7/8的表达与肺腺癌临床总分期相关(P<0.05),CCT2/3/4/5/6A/6B/6P1/7/8的表达与肺腺癌T分期相关(P<0.05),CCT2/4/5/6A/6P1/7/8的表达与肺腺癌N分期相关(P<0.05),CCT4的表达与肺腺癌M分期相关(P<0.05)。CCT2/3/4/5/6A/6P1/7/8在肺腺癌中均高表达(P<0.05),CCT6B在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达比较,差异无统计学意义(P>0.05)。CCT4在肺腺癌中高表达,尤其在有长期吸烟史、发生TP53基因突变或临床分期越晚的肺腺癌患者中高表达(P<0.05)。STRING数据库分析显示,CCT4主要有CCT2、CCT3等20个相关蛋白,富集在伴侣蛋白介导的蛋白质折叠、肌动蛋白的CCT/TRiC折叠、CCT/TRiC法形成微管蛋白折叠中间体和PDCL(PhLP1)与CCT/TRiC在G蛋白β折叠中的协同作用等通路。结论:CCT家族基因尤其是CCT4在肺腺癌的发生发展中起到重要作用,且对肺腺癌的预后有一定预测价值,CCT4可能是一种很有前途的肺腺癌生物标记物。
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