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摘要
【目的】了解广东省某猪群中猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2，PCV2）流行毒株的遗传进化情况，丰富PCV2分子流行病学数据。【方法】使用qPCR方法对疑似PCV2的样品进行检测，检测到了1株具有高病毒载量的PCV2毒株，命名为GD222858。使用PCR方法进行全基因组分子克隆及遗传进化分析。使用MegAlign软件将该毒株ORF1、ORF2基因编码的氨基酸序列与PCV2同亚型参考毒株进行比对，分析氨基酸序列的相似性；DNAStar中的Protean程序预测该毒株的Cap蛋白二级结构及B细胞表位，并与四株疫苗株DBN-SX07-2(HM641752)、LG(HM038034)、SH(HM038027)、ZJ(AY686764)的Cap蛋白抗原指数进行比对分析。【结果】测序结果显示GD222858毒株基因组长度为1767bp。遗传进化树表明该毒株属于PCV2d亚型。与国内外82株参考毒株的核苷酸相似性在91.4%-99.6%，与越南毒株Han8（GenBank登录号：JQ181600）的亲缘关系最近。ORF1编码的Rep蛋白处发现多个特异性突变位点F70Y、F77L、W202R、N256S；ORF2编码的Cap蛋白相对保守。Protean预测Cap蛋白的氨基酸第5-18、24-25、39-41、48-49、57-65、99、101、112-114、139-140、145-150、162-165、175-181、188-189、205-211、227-232位置处均可能存在潜在B细胞表位。GD222858毒株的Cap蛋白抗原指数与4株疫苗株均有差异，在氨基酸45-57、124-132、223-233位置处抗原指数明显高于其它四株疫苗株，且与疫苗株LG（HM038034）差异最大。【结论】该高病毒载量的PCV2毒株为PCV2d亚型，ORF1编码的Rep蛋白处发现多个特异性突变位点F70Y、F77L、W202R、N256S；ORF2编码的Cap蛋白相对保守；B细胞表位处未发现特异性突变；GD222858的Cap蛋白抗原指数分析显示该地区流行毒株与疫苗株LG差异过大。
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