感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析

作者：田保华; 王永勤; 王婵

来源：中国蔬菜, 2012, (16): 36-41.

• 大葱
• 胡葱黄条病毒
• 外壳蛋白基因
• 克隆 Welsh onion
• Shallot yellow stripe virus(SYSV)
• Coat protein gene
• Cloning

以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774bp,均编码258个氨基酸;在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。

• 单位
  北京市农林科学院蔬菜研究中心; 山西大学