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摘要
SRS(SHI RELATED SEQUENCE)是植物特异的转录因子，在植物生长、发育、胁迫应答等过程中发挥重要作用。对棉花SRS基因家族成员进行鉴定和分析，可为进一步研究SRS的功能奠定基础。利用HMMER、Pfam、SMART和NCBI CDD等软件在陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉中鉴定SRS基因家族成员。利用多种生物信息学软件分析了棉花SRSs基因的理化性质、染色体分布、基因结构、进化、启动子顺式作用元件以及在不同组织和不同胁迫条件下的表达模式。结果表明，在陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中分别鉴定出27、13和13个SRSs基因，分布于不同的染色体上，含有1～3个内含子。这些SRSs蛋白均具有RING-like锌指motif和IXGH结构域。棉花SRSs基因上游2000 bp包含大量响应生长发育、激素调控、逆境胁迫的顺式作用元件。进化分析将来自7个物种的83个SRSs蛋白分成7个亚组，棉花SRSs蛋白分布在Group1、Group2、Group3、Group5和Group7亚组中。鉴定了SRSs基因在棉花种内和种间的共线性关系。表达分析表明，多数GhSRSs基因在根中优势表达并响应非生物逆境胁迫。本研究有助于进一步了解SRS转录因子在棉花生长发育及逆境胁迫中的功能。
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