菠菜膜联蛋白Annexin蛋白家族鉴定与表达

作者：杨蛟; 王雪美; 翁莉; 刘梓涵; 蔡晓锋^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-11.

• 菠菜
• Annexin蛋白家族
• 生物信息学
• 表达分析

为克隆和研究菠菜Annexin蛋白家族成员基因及其生物学功能，本研究在菠菜基因组上鉴定出13个菠菜Annexin蛋白家族成员，依次命名为SoANN1～SoANN13；氨基酸数量在219～320 aa间，分子量在35 283.52～36 665.20 kD间，理论等电点(pI)在5.98～9.12间变化；亚细胞定位9个蛋白质定位于细胞质，2个蛋白质定位于细胞骨架，1个蛋白质定位于细胞核，1个蛋白质定位于叶绿体；多序列比对结果菠菜Annexin蛋白家族由4个约70个氨基酸残基的同源结构域(Domain Ⅰ～Ⅳ)组成，各结构域序列间差异较大；系统发育关系结果将13个蛋白序列分成5个亚族；在菠菜Annexin蛋白中鉴定了10个高度保守的基序，所有菠菜Annexin蛋白都包含基序3、5和9，它们构成了菠菜Annexin蛋白中最高度保守的部分；保守结构域分析菠菜Annexin蛋白都含有ANX、Annexin和Annexin superfamily结构域和相似的分布；外显子和内含子分析大多数Annexin蛋白家族基因含有5个内含子；对菠菜Annexin蛋白家族基因起始密码子上游500 bp序列进行顺式作用元件预测，菠菜Annexin蛋白家族基因启动子上顺式作用元件涉及植物发育、非生物胁迫、激素的反应和低温反应等；组织表达分析表明13个菠菜SoANN基因在不同组织部位具有不同的表达情况；本研究为后续深入研究菠菜Annexin蛋白家族成员的功能提供了重要参考。

• 单位
  上海师范大学; 生命科学学院