合作教学在随班就读实践中面临困境。具体表现为:合作教学覆盖率低;合作教学随意性大、规范性不强,效果不佳;合作教学方式单一且不完整,合作程度低。究其缘由,这与随班就读支持保障体系不健全、随班就读教师对于合作教学的本质认识不清、教师培训缺乏合作教学的策略和方法有重要关系。其出路在于:健全完善随班就读支持保障体系;加强师资培训,为合作教学奠定技术基础;引导转变随班就读教师教学理念,树立合作教学理念。