基于全转录组技术研究慢性应激抑郁模型中微小RNA、长链非编码RNA及环状RNA的表达谱及调控网络

作者：孟盼; 张熙; 杨蕙; 刘检; 方锐; 王枭冶^*; 葛金文^*; 刘彤彤; 赵洪庆; 王宇红

来源：解剖学报, 2023, 54(04): 405-413.

DOI：10.16098/j.issn.0529-1356.2023.04.005

• 微小RNA
• 长链非编码RNA
• 环状RNA
• 抑郁症
• 神经可塑性
• 全转录组技术
• 大鼠

目的 筛选慢性应激抑郁模型大鼠海马组织中微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)的表达谱及其竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络，探讨抑郁症潜在的病理生理机制。方法 12只SD大鼠分为空白组和模型组，采用慢性温和不可预测性应激(CUMS)构建抑郁症大鼠模型，取大鼠海马组织进行全转录组分析，并用生物信息学方法找出可能存在的lncRNA-miRNA-mRNA、circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果 根据|差异倍数(fold change)|≥1.5和P≤0.05共鉴定出29个差异miRNAs(上调21个，下调8个),686个差异lncRNAs(上调163个，下调523个),8个差异circRNAs(上调3个，下调5个)。基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示，miRNAs的靶基因主要富集于细胞膜内的高尔基体和钙离子结合过程；LncRNAs靶基因的功能涉及核酸结合的调节、细胞因子和蛋白质泛素化等；CircRNAs的宿主基因主要集中在细胞刺激反应、代谢进程、催化活性等过程中。LncRNAs和circRNAs相互竞争的ceRNA网络显示，非编码RNA(ncRNA)与突触可塑性相关的mRNA之间存在复杂相互作用，如与轴突导向相关的Wnt-ta蛋白(WNT5a)和Ⅷ型胶原α1(COL8α1),以及神经发育相关的层黏连蛋白A2(LAMA2)。结论 LncRNA和circRNA的ceRNA网络显示，ncRNA和mRNA之间的复杂相互作用与抑郁症的神经可塑性受损有关。

• 单位
  湖南中医药大学; 湖南省脑科医院; 湖南中医药大学第一附属医院; 湖南省中医药研究院