阿尔茨海默病相关的生物信息学分析

作者：高慧丽; 王笑寒; 李燕飞; 段冉冉; 滕军放; 彭涛; 贾延劼

来源：中国老年学杂志, 2015, 35(17): 4815-4819.

• 阿尔茨海默病
• 生物信息学
• 信号通路
• Hub基因

目的探讨阿尔茨海默病(AD)发生发展相关的基因。方法 1利用生物信息学方法挖掘现有文献,NLP分析方法进行关于AD文献挖掘。2Gene Ontology(GO)分析方法进行相关基因功能分类。3Pathway分析方法统计基因在每个Pathway中的富集程度。4基因网络分析方法将上述三种结果整合为基因间的相互关系网络,并筛选出AD相关信号转导通路中的枢纽基因(Hub基因)。结果与AD发生发展相关的文献和基因分别为8 900篇和898个,绘制与AD发生发展有关的相关基因的生物信号网络,发现AD相关基因的表达参与到14种生物学过程、12种细胞的组成和25个不同的信号转导通路(P<0.01),执行9种生物分子功能,并与24种疾病(P<0.01)的发生发展有关。研究基因/蛋白质相互作用发现,PIK3CG等21个为AD相关基因网络中连接程度最高的21个基因(P<0.05),即Hub基因。结论文献挖掘得到的相关信号通路(Cytokine-cytokine receptor interaction信号通路)及Hub基因(PIK3CG、CBL)与AD的发生发展密切相关。

• 单位
  第一附属医院神经内科; 郑州大学