东方百合‘索邦’组蛋白去乙酰化酶基因LoSorHDA1的克隆与表达分析

作者：蒙娟; 杨捷; 彭梦笛; 贾桂霞; 何恒斌^*

来源：西北农业学报, 2020, 29(02): 315-325.

• 百合‘索邦’
• LoSorHDA1
• 基因克隆
• 基因表达

以东方百合‘索邦’(Sorbonne)为材料,结合前期转录组数据,克隆组蛋白去乙酰化酶基因 HDA1(Histone deacetylases),命名为 LoSorHDA1。 LoSorHDA1序列长1 518 bp,编码505个氨基酸,生物信息学预测含有一个高度保守的组蛋白去乙酰化结构域。系统进化分析表明,LoSorHDA1与拟南芥等物种的HDA1同源蛋白聚为一支,而与HDAC家族其他成员关系较远; LoSorHDA1编码的氨基酸序列与单子叶植物小果野焦(Musa acuminata)的相似度最高,而双子叶植物HDA1则聚为另一支。RT-PCR结果显示: LoSorHDA1在‘索邦’不同组织中普遍表达,其中在茎生根、嫩茎、花被片、花丝、柱头、花柱、子房中表达量较高,在下部叶和花药中表达稍弱。亚细胞定位表达结果表明,LoSorHDA1定位在细胞核和细胞质中。荧光定量PCR结果显示: LoSorHDA1在不同花发育阶段中的各个花部组织中均有不同程度的表达,在雌雄蕊中表达趋势相反,而在内外花被片中的表达趋势较为一致,说明 LoSorHDA1可能参与东方百合花发育进程,这为后续 LoSorHDA1的去乙酰化修饰在百合花发育中的功能研究奠定基础。

• 单位
  国家花卉工程技术研究中心