基于表观遗传学探索玉米双向启动子对转录的影响

作者：朱倩洁; 曹亚欣; 马宇馨; **旺; 邢继红; 张康^*; 董金皋^*

来源：河北农业大学学报, 2020, 43(01): 24-47.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2020.0004

• 双向启动子
• 易接近染色质区域
• 组蛋白修饰
• 玉米

为了探索玉米中表观遗传修饰对双向启动子及相关基因表达的调控作用,本研究通过整合公共数据平台中表观基因组和转录组数据,对易接近染色质区域(Accessible chromatin regions, ACRs)和组蛋白修饰进行分析并探索其对玉米双向启动子(Bidirectional promoter, BDP)及相关基因的影响。结果发现,ACRs与转录起始位点(Transcription start site, TSS)之间的距离能够影响相应基因的表达水平:ACRs距离TSS越近,基因表达水平越高;ACRs距离TSS越远,基因表达水平越低。ACRs的分布位置在基因对的共同表达过程中起着重要的作用,这可能是通过编排BDPs周围的组蛋白修饰和开放染色质区域转录因子的结合来调节转录的。染色质结构的动态变化,ACRs和组蛋白修饰的共同作用,在调控基因组中具有BDPs的基因对及其共表达方面起着重要的作用。因此,本研究的发现可能有助于增进对ACRs和组蛋白修饰调控相关基因对转录过程的理解,为进一步探索双向启动子在玉米分子育种的功能奠定理论基础。

• 单位
  河北省荣军医院; 河北农业大学; 生命科学学院