焦磷酸测序技术快速检测鉴定临床尿液标本中真菌方法学的建立与应用

作者：吕江峰; 周静; 潘彩霞; 任绪义^*

来源：中华传染病杂志, 2018, 36(11).

• 真菌
• DNA,核糖体
• 内转录间隔区
• 焦磷酸测序

目的建立一种快速检测鉴定临床尿液标本中常见真菌的方法学体系。方法收集临床尿液样本,提取DNA,利用PCR方法结合焦磷酸测序技术检测真菌的rDNA内转录间隔区,通过序列比对鉴定真菌种属。结果通过PCR-焦磷酸测序与常规培养相比较,1 320例临床样本培养阳性180例,阳性率为13.6%.焦磷酸测序鉴定阳性192例,阳性率为14.5%。两种方法检测真菌阳性符合率为100. 00%,阴性符合率为98. 95%,总体符合率为99. 09%,Kappa值为0. 963,一致性较好。对13株标准菌株鉴定结果与实际结果相符。结论研究所建立的PCR-焦磷酸测序直接检测临床尿液标本真菌的方法,具有快速、准确性高、重复性好、高度自动化、低成本、高灵敏度、高通量(可一次性检测96个样品)等优点,无需常规培养,能在3 h内一次性区分临床常见真菌,可作为一种快速检测鉴定临床标本中真菌的方法。