旱柳、杞柳ACO基因家族的全基因组鉴定及表达分析

作者：冯志聪; 邹航; 果弘毅; 钟非; 陈艳红; 余春梅; 连博琳; **; 刘国元^*

来源：扬州大学学报（农业与生命科学版）, 2022, 43(02): 10-19.

DOI：10.16872/j.cnki.1671-4652.2022.02.002

• 柳属
• 旱柳
• 杞柳
• 速生性
• ACO基因家族
• 生物信息学

1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase, ACO)是植物中乙烯生物合成途径的限速酶。以ACO蛋白的保守结构域特征为基础，在旱柳(Salix matsudana)和杞柳(Salix integra)的全基因组测序结果中分别鉴定出42和33个ACO蛋白；并运用系列生物信息学方法分析其进化关系、基因结构、理化性质与表达模式等。结果表明：该家族成员可分为10个组，每组的保守基序特征与进化树基本一致。ACO基因含有3～6个外显子，编码238～438个氨基酸，蛋白质理论PI值在5.03～9.52之间，分子量为9.794～48.537 ku;染色体定位显示旱柳ACO基因分布在19条染色体上，部分基因串联重复形成基因簇。热图结果发现ACO基因家族成员在速生性强、弱品系中的表达水平具有差异性。

• 单位
  生命科学学院; 南通大学