乳头状肾细胞癌诊断和预后相关miRNA的生物信息学研究

作者：王宁; 刘昌伟; 褚校涵; 王晓甫; 赵兴华; 郝斌; 许长宝^*

来源：河南医学研究, 2023, 32(18): 3275-3281.

• 乳头状肾细胞癌
• miRNA
• 预后
• 生物信息学

目的 挖掘乳头状肾细胞癌(PRCC)诊断和预后相关miRNA,探索其临床意义。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取PRCC miRNA表达谱数据，包含miRNA-seq和临床数据。利用R语言筛选PRCC组织和正常组织差异表达miRNAs。通过单因素Cox、LASSO及多因素Cox回归分析筛选与预后相关的miRNAs,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价与预后相关miRNAs诊断PRCC的准确度和敏感度。借助TransmiR和Genecards数据库预测miRNAs的转录因子。通过miRDB、TargetScan、miRTarBase数据库预测miRNAs靶基因，并借助DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析。利用TIMER数据库分析靶基因表达与免疫细胞浸润水平的相关性。结果 PRCC组织与正常组织的差异表达miRNAs共163个，其中hsa-miR-34a及hsa-miR-551b与PRCC预后相关，随着肿瘤进展，其表达下调，其高表达则PRCC患者总生存率更高。ROC曲线提示hsa-miR-34a诊断PRCC的曲线下面积(AUC)>0.7,准确度更高。hsa-miR-34a的表达受TP53等44个转录因子的调控。功能富集分析显示hsa-miR-34a的靶基因参与细胞因子负调控、miRNAs与癌症通路等，且参与细胞因子负调控的靶基因PPP1R11及LGR4表达和PRCC多种免疫细胞的浸润水平相关。结论 hsa-miR-34a与PRCC诊断和预后相关，可作为PRCC诊断和预后评估的生物标志物。

• 单位
  郑州大学第二附属医院