蓝塘猪和大约克猪TPM3基因单核苷酸多态性分析

作者：朱良瑞; 李加琪^*; 袁晓龙

来源：黑龙江畜牧兽医, 2023, (15): 47-56.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2022.08.0085

• 蓝塘猪
• 大约克猪
• TPM3基因
• 单核苷酸多态性
• 肉质性状

为了了解蓝塘猪与大约克猪TPM3基因编码序列(coding sequence, CDS)的多态性，试验选择健康肥育蓝塘猪30头和大约克猪35头作为试验动物，采用PCR方法扩增两个猪群的TPM3基因cDNA序列，测序分析其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)。结果表明：在猪TPM3基因cDNA序列中查找到6个SNPs位点，涵盖猪TPM3基因5′非编码区(UTR)和CDS区；在5′UTR仅存在U-45 SNP位点，为单碱基缺失；在CDS区存在E3-440、E3-452、E4-565、E6-650、E6-658共5个SNPs位点，包括3个单碱基转换，1个单碱基颠换，1个单碱基缺失。E3-440由丙氨酸变为甘氨酸，E3-452由谷氨酸变为甘氨酸，E4-565由异亮氨酸变为缬氨酸，E6-650由异亮氨酸变为苏氨酸，E6-658由亮氨酸变为色氨酸；E3-452与谷氨酸含量关联，谷氨酸作为影响猪肉的主要鲜味物质之一对猪肉风味有影响。说明E3-452可作为影响猪肉鲜味的SNP位点。

• 单位
  广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室; 荆州职业技术学院; 华南农业大学