海南澳洲管体星虫线粒体基因组特征及进化分析

作者：黄培贤; 姚雪梅; 余巧驰; 张佳玉

来源：热带海洋学报, 2022, 1-10.

• 澳洲管体星虫
• 海南
• 线粒体基因组
• 进化

澳洲管体星虫是海南当地的特色海产资源,隶属管体星虫属。该属在星虫动物门内的分类地位一直极具争议。本研究通过高通量测序测定海南文吕地区澳洲管体星虫的线粒体基因组,与GenBank中收集的星虫线粒体基因组进行比对分析,解析其基因组序列特征,并进一步探讨管体星虫属在星虫动物门内的进化地位。结果显示:澳洲管体星虫线粒体基因组长度为16 483bp,包含38个基因(13个蛋白质编码基因、23个tRNAs和2个rRNAs)。线粒体基因组呈AT偏好,其A+T的含量为65.87%。分析相对同义密码子使用度发现,澳洲管体星虫线粒体蛋白质编码基因对结尾为A和U的密码子具有明显偏好性。澳洲管体星虫线粒体蛋白编码基因COX1、COX3、ND5的氨基酸数量与其他星虫比较,差异较大。澳洲管体星虫与GenBank中收集的星虫线粒体基因组的主编码基因中,COX1、COX2和CYTB基因变异位点比例低,而ND2、ND4L和ND6基因变异位点比例高,ATP8基因的变异位点的比例最高(83.33%)。利用线粒体基因组核酸序列构建的NJ(neighbor-joining)、ML(maximum likelihood)、BI(Bayesian inference)进化树显示,管体星虫属介于革囊星虫属和方格星虫属之间,与革囊星虫属关系较近,反而与方格星虫属的关系较远,与传统的形态学分类不一致。形态学上,管体星虫属混合了革囊星虫属和方格星虫属的形态特征,而线粒体基因组构建的进化树更能体现管体星虫属真实且独特的进化地位。线粒体基因组数据为解释管体星虫属的进化地位提供了理论依据,同时有利于澳洲管体星虫遗传资源的保护和开发。

• 单位
  海南大学