基于GenBank数据库的不同基因型细粒棘球绦虫系统进化分析

作者：吴世乐; 朱文君; 范得艳; 石兵强; 安永德; 王春亮; 韩秀敏^*; 郭亚民^*

来源：中国血吸虫病防治杂志, 2020, 32(01): 36-59.

DOI：10.16250/j.32.1374.2019147

• 细粒棘球绦虫
• 基因型
• 进化分析
• 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ

目的分析GenBank数据库中公布的细粒棘球绦虫各基因型细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(Cox1)基因序列,探索细粒棘球绦虫各基因型在全球不同地区的遗传变异及分化情况。方法收集GenBank数据库中公布的不同基因型细粒棘球绦虫Cox1基因序列,排除同一地区内相同基因序列,寻找收集的基因序列间的变异位点并构建进化树,观察不同地区细粒棘球绦虫各基因型的地域聚集性及原始基因序列。结果通过对Cox1基因序列变异位点统计,发现细粒棘球绦虫Cox1基因突变类型以颠换为主,G1、G6、G7基因型在其分布的各地区均有相同Cox1基因序列,基因序列相对应的GenBank登录号分别为KY766891、MH300971、MH301007。系统进化分析发现G10基因型存在明显地域聚集性。结论细粒棘球绦虫G1、G6、G7基因型存在原始Cox1基因序列;G10基因型进化树中出现地域聚集性,存在生殖隔离趋势。

• 单位
  青海省人民医院; 青海省红十字医院