白腐真菌降解麦麸纤维关键基因挖掘

作者：宋鑫; 苏浩; 蒋诗雨; 李力^*

来源：河南工业大学学报(自然科学版), 2022, 43(05): 94-101.

DOI：10.16433/j.1673-2383.2022.05.013

• 白腐菌
• 降解
• 麦麸纤维
• 转录组
• 关键基因

白腐真菌是已知能高效降解木质纤维素的微生物之一，为预测和筛选白腐真菌与麦麸纤维降解有关的基因，对白腐菌A.polytricha 5.584分别以麦麸纤维和葡萄糖为单一碳源的液态培养环境下的转录组进行高通量测序，并利用GO等数据库对转录本进行比较分析。转录组测序共得到38.18 Gb数据，各样品的Clean Reads与参考基因组的比对效率在86.29%～88.85%之间，FPKM密度分布表明分组合理且组间存在差异；使用DEGseq筛选差异表达基因，并与七大功能数据库系统开展比对注释，共得到上调基因8 214条，下调基因3 882条，其中有8 638个被注释到GO数据库，4 310个被注释到KEGG数据库；使用DIAMOND软件对差异表达基因进行蛋白互作分析，筛选出互作关系评分≥300的网络关系作图，得到5个与白腐菌降解麦麸纤维相关的重要关键基因：CL16.Contig1＿All、CL1024.Contig1＿All、CL2915.Contig1＿All、CL710.Contig10＿All、CL3860.Contig3＿All,为深入研究白腐菌对麦麸膳食纤维的降解机制提供参考。

• 单位
  河南工业大学; 粮油食品学院