提出一种基于神经网络谐波平衡的高速移动通信GSM-R干扰信号分离算法。构建高速移动通信信道模型并设计码内干扰抑制算法,根据Fourier变换的可逆性,采用神经网络控制算法进行系统稳定性控制,得到高速移动通信数据传输的GSM-R信号多径结构谐波平衡方程,设计神经网络谐波平衡滤波器结构,实现对GSM-R干扰信号的优化分离。仿真结果表明,采用该算法能效实现对高速移动通信中的GSM-R干扰信号分离,输出信噪比有较大幅度的提高,大幅降低了高速移动通信系统的误码率,改善通信质量和性能。