豚鹿SSR标记开发与遗传多样性分析

作者：耿广耀; 由玉岩; 刘群秀^*

来源：野生动物学报, 2022, 43(03): 816-820.

• 豚鹿
• 微卫星
• 分子标记开发
• 遗传多样性

以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA，利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序，并用MISA检索SSR标记。结果表明：单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布，其中双碱基重复占比最高，在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记，这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个，在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421，平均期望杂合度(He)为0.513。7个SSR标记中有3个高度多态标记、 3个中度多态标记和1个低度多态标记，可用于豚鹿的遗传多样性研究。

• 单位
  北京动物园; 上海动物园