条斑紫菜单孢子形成相关基因（PyMFG）的特性及其表达差异

作者：宋珊珊; 丁洪昌; 严兴洪

来源：水产学报, 2019, 1-12.

• 条斑紫菜
• RNA-Seq
• 单孢子
• PyMFG
• TEA-ATTS超家族
• qRT-PCR

本实验以条斑紫菜转录组测序筛选得到的差异性表达基因（Contig-21827）序列为基础，采用RT-PCR技术克隆得到了条斑紫菜单孢子形成相关基因PyMFG的完整开放阅读框。对其进行序列分析发现，PyMFG基因的ORF全长为1 224 bp，编码一个包含407个氨基酸的多肽片段，其分子量为46.24 ku，等电点为9.08。结构域分析结果显示，该蛋白含有保守的TEA结构域和YAP结构域，属于TEA-ATTS超家族结构域。通过多序列比对和系统进化分析发现，该蛋白与真菌分生孢子形成蛋白聚为一个大的分支，亲缘关系较近。此外，不同品系间的单孢子放散能力和qRT-PCR分析结果显示，PyMFG基因在PY26W和PY26W’ 品系中的表达趋势与宏观统计结果高度一致，在PY26R和PY26R’ 品系中的表达则与统计结果存在差异。由此推断，父本（PY26W）/偏父本品系（PY26W’）中调控单孢子形成、放散的相关基因种类和具体分子机制与母本（PY26R）/偏母本品系（PY26R’）存在差异，因而导致单孢子的宏观统计结果与荧光定量结果存在差异。

• 单位
  上海海洋大学