基于高通量测序的黑胸大蠊转录组分析

作者：齐润姿; 高雪萌; 魏丹丹

来源：中国国境卫生检疫杂志, 2016, 39(05): 319-323.

DOI：10.16408/j.1004-9770.2016.05.004

• 黑胸大蠊
• 高通量测序
• 转录组

目的利用转录组技术获得非模式生物黑胸大蠊的大量转录组数据,为今后开展分子生物学研究打下基础。方法利用Illumina测序技术对黑胸大蠊Periplaneta fuliginosa进行转录组测序。测序结果取阈值e≤10-10在SwissProt、NR、KEGG、COG、GO和Pfam等公共序列数据库进行比对。结果获得黑胸大蠊转录组信息数据量13.63 G,39576个unigene,总长度32 297 597 bp,最长27 693 bp,平均长度816 bp。共获得61 167个注释结果。发现黑胸大蠊单核苷酸的多态性位点(SNP)置换33 955个,颠换16 561个,找到2 666个微卫星序列。结论数量巨大的转录组信息为黑胸大蠊新基因的克隆和基因组学研究提供了有价值的信息。

• 单位
  西南大学; 浙江出入境检验检疫局; 温州出入境检验检疫局