粗粒化模型被广泛地应用于蛋白质结构与功能的多尺度模拟研究,发展蛋白质的粗粒化模型为研究生物大体系提供了重要的理论工具。在此报告中,我们介绍了对蛋白质超粗粒化模型发展的尝试。我们已经发展了蛋白质超粗粒化粒子的快速优化方法与算法,利用这些方法可以优化得到表达蛋白质体系的超粗粒化粒子。我们进一步利用经验的势能函数对超粗粒化粒子进行了参数化,并构建了有效的超粗粒化模型。我们将运用发展的超粗粒化模型与其它模拟方法一起研究信号蛋白Ras的构象与功能。
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