荆芥萜类合成酶(TPS)基因家族鉴定与分析

作者:贾聪玲; 舒娟; 党静洁; 王雪; 吴啟南*; 刘潺潺*
来源:中国中药杂志, 2023, 48(22): 6039-6050.
DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20230712.101

摘要

萜类化合物兼具药理活性和经济价值,是植物重要的次生代谢产物,而萜类合成酶(TPSs)是其合成过程的关键酶。为了探究荆芥中TPS基因家族成员及其潜在的功能,该研究基于荆芥全基因组数据,采用生物信息学方法,对荆芥萜类合成酶基因家族进行了系统分析。结果表明从荆芥基因组数据库中共鉴定获得57个StTPS成员,StTPS家族成员编码285~819个氨基酸,蛋白相对分子质量在32.75~94.11 kDa,均为亲水性蛋白。StTPS家族成员主要分布在细胞质和叶绿体,其物理定位呈现出随机不均匀的特点。系统进化分析结果显示StTPS基因家族分为6个亚组,主要为TPS-a、TPS-b亚家族成员。通过启动子分析预测,荆芥TPS基因家族成员能响应光、脱落酸及MeJA等多种胁迫。转录组数据分析结果表明,荆芥中的TPS基因大多数在根中表达,同时对叶中高表达而根中低表达的基因进行qRT-PCR分析。通过对于荆芥TPS基因家族的分析,该研究筛选出可能参与荆芥倍半萜合成的基因StTPS5、StTPS18、StTPS32、StTPS45,并对StTPS45进行了克隆及原核表达载体的构建,可为进一步探究荆芥TPS基因家族的功能及在倍半萜合成中的作用提供参考。

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