基于Java3D的蛋白质相互作用网络成像软件

作者：金鼎立; 答亮; 冯铁男; 王翼飞

来源：微计算机信息, 2011, (11): 98-99+11.

• 蛋白质-蛋白质相互作用网络
• 质心分布
• 三维显示
• 立体双图 Protein-Protein Interaction Network
• Barycenter Distribution
• 3D Display
• Stereo Pair

蛋白质-蛋白质相互作用网络三维呈现对于蛋白质组学的进一步研究有着重要的促进作用。本文利用Java6.0开发工具包,设计了一个蛋白质相互作用网络显示的软件(Protein-Protein Interaction Network Expandor,简称PINE)。PINE从目前三个常用的蛋白质相关数据库中提取信息,经整合后将蛋白质的综合信息呈现给用户。在二维相互作用网络图的基础上,利用Java3D绘制了三维蛋白质相互作用网络图。此外,PINE还引入三维立体双图,增强了网络图的立体层次感。

• 单位
  中国科学院; 上海大学