EB病毒潜伏膜蛋白1的B细胞表位预测

作者：黄建华; 叶少雄; 李朝霞; 彭海山

来源：中国微生态学杂志, 2011, (11): 979-981.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.2011.11.015

• EB病毒
• 潜伏膜蛋白1
• B细胞表位 Epstein-Barr virus
• Latent membrane protein 1
• B cell epitope

目的预测EB病毒潜伏膜蛋白1(Latent Membrane Protein1,LMP1)的B细胞表位。方法基于EB病毒基因组序列,采用DNAStar Lasergene软件包中的Protean软件,对LMP1的亲水性,表面可能性,抗原指数及其二级结构中的柔性区域进行分析,并结合吴玉章的抗原指数预测法预测其B细胞表位。结果 B细胞表位最有可能位于潜伏膜蛋白N端第356-358,2-19,249-314区段或其附近,而潜伏膜蛋白N端第185-223区段内或附近也可能存在B细胞表位。结论用多参数预测EB病毒LMP1的B细胞表位,为鼻咽癌的筛查及抗肿瘤转移靶向治疗的分子免疫学研究奠定基础。

• 单位
  中山大学附属第三医院; 中山大学