口腔鳞癌中预后相关miRNA的生物信息学分析及实验验证

作者：苟秋童; 谢强; 靳文珂; 廖敏茹; 李自祥; 黄海霞^*

来源：现代肿瘤医学, 2023, 31(16): 2988-2995.

• 口腔鳞癌
• miRNA
• 生物信息学
• 预后
• 生物标志物
• 风险模型
• PIK3CB

目的:通过生物信息学筛选与口腔鳞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)预后显著相关的miRNA,并通过体外实验进行验证。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)下载OSCC患者数据。通过R分析差异表达的miRNA。使用回归分析建立风险模型。通过Kaplan-Meier生存分析预测OSCC患者预后。通过受试者操作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线及回归分析验证风险模型可靠性。使用GO和KEGG分析预测预后相关miRNA的生物学功能。通过qRT-PCR及Western blot对生物信息学结果进行体外验证。结果:20个miRNA在OSCC中差异表达；miR-204-5p及miR-503-3p与OSCC预后显著相关；本研究构建的风险模型能有效预测OSCC预后；GO分析显示miR-204-5p与细胞凋亡、增殖及迁徙相关，而miR-503-3p与细胞分化、细胞周期及GTP结合有关；KEGG分析显示miR-204-5p与PI3K/Akt/mTOR通路及自噬通路相关，而miR-503-3p与Ras通路及HIF-1通路相关；qRT-PCR显示OSCC细胞中miR-204-5p表达量下降(P<0.05),瞬时转染miR-204-5p mimic后OSCC细胞中miR-204-5p表达量明显升高(P<0.05);Western blot显示升高miR-204-5p后OSCC细胞中PIK3CB表达量明显下降(P<0.05)。结论:miR-204-5p及miR-503-3p是OSCC中有效的预后生物标志物。miR-204-5p及miR-503-3p构建的风险模型能有效预测OSCC患者预后。miR-204-5p在OSCC细胞中低表达，升高miR-204-5p后OSCC细胞中PIK3CB的表达量下降。

• 单位
  西南医科大学; 四川大学华西医院; 西南交通大学