病毒性脑炎是一种累及脑膜和脑实质的中枢神经系统感染性疾病,其临床表现为发热、抽搐、头痛等。因病毒性脑炎早期缺乏特异性临床症状,且病死率和致残率均较高,所以早期诊断尤为重要。本文介绍了3例采用宏基因组测序(mNGS)技术早期诊断出儿童疱疹病毒性脑炎的病例资料,相较于病毒性脑炎的传统检测方法,脑脊液二代测序能及早地做出病原学诊断,在早期诊断和指导临床治疗方面有重要的参考价值。