芹菜TCP基因家族全基因组鉴定、进化分析和表达研究

作者：周瑾; 李洁; 李晓燕; 肖丹怡; 李梦瑶^*

来源：四川农业大学学报, 2022, 40(02): 145-155.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.202110039

• 芹菜
• TCP转录因子
• 系统进化
• 表达分析
• 高温胁迫

【目的】鉴定芹菜基因组中TCP转录因子基因家族成员，为开展芹菜TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】基于芹菜全基因组数据，对TCP家族成员进行了鉴定，系统分析了该家族成员的理化性质、基因结构、蛋白功能域、染色体分布、系统进化和转录表达丰度等，并采用qRT-PCR验证TCP参与了高温胁迫的应答。【结果】芹菜中共鉴定出29个TCP基因，将其划分为2个大的亚族ClassⅠ与ClassⅡ；TCP家族绝大多数基因位于染色体上且分布不均，只有2个基因位于重叠群上；所有成员均含有保守的结构域；进化分析发现伞形科作物的TCP基因亲缘关系较近；TCP家族成员的启动子区域显著富集与生长发育、激素响应和逆境应答相关的顺式元件；TCP家族大多数基因在芹菜叶片中高表达，且在白色、绿色和红色芹菜中的表达丰度都较高，且ClassⅠ亚族还参与了高温胁迫的应答。【结论】研究结果有助于进一步了解芹菜TCP家族成员的系统进化和基因功能，为今后芹菜的基因工程改良提供了一定的理论基础。

• 单位
  四川农业大学