牦牛病毒性腹泻病毒全基因测序及生物信息学分析

作者：王研; 刘亚刚; 王荣; 孙凯

来源：中国畜牧兽医, 2013, (03): 33-38.

• 牦牛病毒性腹泻病毒
• 全基因序列分析
• 生物信息学分析 bovine viral diarrhea virus of Yak
• whole genome sequence analysis
• bioinformatics analysis

从牦牛(Yak)体内分离出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒(BVDV/MDV),参考GenBank中已收录的BVDV-Ⅰ型的全基因组序列,设计了19对引物,通过RT-PCR方法,对牛病毒性腹泻病毒牦牛株进行克隆及测序,得到其全基因组序列(Gen-Bank登录号:JQ799141),序列全长12214nt,其中5′-UTR长288nt,3′-UTR长232nt。将牦牛株BVDV全基因序列与Gen-Bank中登录的其他8株BVDV病毒全基因序列进行同源性比对及系统进化分析,结果表明,牦牛株BVDV与BVDV-Ⅰ型毒株出于同一分支,但与其他8株BVDV毒株全基因序列同源性均不高,有可能属于新的独立基因型或基...

• 单位
  西南民族大学