葡萄EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

作者：毛娟; 梁国平; 卢世雄; 马宗桓; 王萍; 陈佰鸿^*

来源：中外葡萄与葡萄酒, 2019, (06): 12-19.

DOI：10.13414/j.cnki.zwpp.2019.06.002

• 葡萄
• EST-SSR
• 遗传多样性

为开发高效实用的EST-SSR基因标记,从220 547条葡萄EST序列中共搜索到20 687条至少含有1个SSR位点的EST序列,占EST总数的9.3%。高频率重复类型为一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸,占EST-SSR总数的95.7%,其他重复类型仅占4.3%。其中最常见的是一核苷酸重复,其次是二核苷酸重复。从葡萄SSR分析表中筛选出25对EST-SSR引物并对52份葡萄材料进行PCR扩增,结果表明:25对EST-SSR引物在52个葡萄品种中共扩增出条带1033条,其中多态性条带为671条,多态率高达65%。采用NTSYS聚类分析法构建系统树,通过EST-SSR标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致,说明通过此方法获得的EST-SSR可以作为有效标记用于葡萄遗传多样性分析及遗传图谱构建等。

• 单位
  甘肃农业大学