微生物组测序与分析专家共识

作者：段云峰; 王升跃; 陈禹保; 杨瑞馥; 李后开; 朱怀球; 童贻刚; 杜文斌; 付钰; 胡松年; 王军; 辛玉华; 赵方庆; 鲍一明; 张雯; 李娟; 曾明; 牛海涛; 周欣; 李岩; 崔生辉; 袁静; 李俊桦; 王加义; 刘东来; 倪铭; 孙青; 邓晔; 朱宝利

来源：生物工程学报, 2021, 36(12): 2516-2524.

• 微生物组
• 高通量基因测序
• 专家共识
• 国家标准
• 微生物组计划

在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略地位。此外,无论是科研还是产业应用已经迎来了研究高潮和投融资热潮,微生物组相关产品和服务也不断出现。然而,行业在快速发展的同时,也存在一些不足。由于微生物组测序和分析相关技术和方法发展迅速,各国研究和应用尚未在技术、方案和数据等标准上达成统一,国内行业参与者对微生物组也存在认识不足,对微生物组相关新方法、新技术、新理论等还未能充分掌握和使用。除此之外,已有的一些标准和指南,内容过于简单,实操性也不足,这不仅给科研数据的整合造成了困难和资源浪费,还给相关企业进行不良竞争、以次充好提供了机会。更重要的是,我国尚缺乏微生物组相关的国家标准,国家微生物组计划仍处于筹备过程。在此背景下,中国生物工程学会、中国科学院微生物研究所于2019年6月至2020年3月,共同设立了"微生物组测序与分析专家共识"专项研究课题。中国生物工程学会组织了微生物组相关领域的27位专家以及来自行业内的30多位专业人员,通过分成4个项目小组、召开4轮研讨会后,最终形成了涵盖从微生物采集与保存、DNA提取与建库、高通量基因测序和数据分析以及质控标准品等全流程的"微生物组测序与分析专家共识"。本专家共识具有较强可参考性和可操作性,不仅能指导国内科研和产业机构规范进行微生物组相关产、学、研,还能为国家相关职能部门提供可参考的技术依据,保障规模型和规范化的企业利益,加强行业自律,避免不规范的企业扰乱市场,最终促进微生物组相关产业的良性发展。

• 单位
  深圳华大生命科学研究院; 上海中医药大学; 北京化工大学; 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所; 中国科学院北京生命科学研究院; 中国科学院生态环境研究中心; 中国农业大学; 中国科学院生物物理研究所; 北京市计算中心; 中国人民解放军军事科学院; 北京协和医学院; 上海交通大学医学院附属瑞金医院; 中国食品药品检定研究院; 北京大学; 中国科学院北京基因组研究所; 中国科学院微生物研究所; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 首都儿科研究所