基于TCGA数据分析UHRF1在低级别胶质瘤中的表达与预后

作者:郭兆刚; 岳博; 霍云龙; 祖静; 邓超; 万妍*
来源:解剖科学进展, 2022, 28(05): 610-613.
DOI:10.16695/j.cnki.1006-2947.2022.05.025

摘要

目的 探究泛素样含PHD和环指域蛋白1(UHRF1)在低级别胶质瘤中表达水平及与患者预后之间的联系。方法 从TCGA数据库中下载提取低级别胶质瘤样本和在GTEx数据库中的正常脑组织样本的转录组数据合并后分析UHRF1的表达水平;分析比较UHRF1表达水平高低不同的低级别胶质瘤患者组的预后区别;GSEA富集分析UHRF1在低级别胶质瘤中主要参与的信号通路;通过TIMER数据库分析低级别胶质瘤组织中UHRF1表达与常见的免疫细胞浸润的相关性;选取6例低级别胶质瘤组织及3例非癌脑组织,通过RT-qPCR的方法验证UHRF1在低级别胶质瘤与非癌脑组织的表达情况。结果 UHRF1在低级别胶质瘤组织中的表达量明显高于非癌脑组织,且UHRF1表达水平高的患者在预后相对更差(P<0.01);富集分析显示,UHRF1可能通过MYC_TARGETS_V2通路在低级别胶质瘤中发挥作用;在低级别胶质瘤组织中,UHRF1的表达与巨噬细胞呈正相关(P<0.01);在收集到的病例中,与非癌脑组织相比,UHRF1在低级别胶质瘤中的表达显著增高(P<0.001)。结论 UHRF1在胶质瘤中高表达且有着更差的预后,其可能成为治疗低级别胶质瘤的潜在靶点。

  • 单位
    中国医科大学附属盛京医院