谷子SSR标记在狗尾草中的有效性检测

作者：相吉山; 贾斌; 张佳乐; 王冬雪; 永辉; 王春苗; 赵舒楠; 王伟平; 赖佳成; 王宇

来源：农业技术与装备, 2019, (04): 17-21.

• 青狗尾草
• SSR标记
• 有效性

狗尾草(S. viridis (L.) Beauv.)为一年生草本植物,是谷子(S. italica (L.) P. Beauv.)的祖本植物。本研究采集赤峰地区狗尾草种质资源,随机挑选40份材料,利用种子发芽并提取叶片基因组DNA,构建混池。利用361对谷子SSR标记对狗尾草基因组DNA混池进行PCR检测,有311对(86.15%)标记能够扩增出目的片段。其中,1号～9号染色体SSR标记依次为38对、42对、43对、34对、42对、34对、8对、26对、44对,平均距离依次为1.11Mbp、1.17Mbp、1.18Mbp、1.19Mbp、1.13Mbp、1.06Mbp、4.50Mbp、1.57Mbp、1.34 Mbp。相比较而言,1号染色体上的SSR标记在检测狗尾草时有效性最高(100.00%),7号染色体上的有效性最低(24.24%),说明谷子不同染色体上的SSR标记在狗尾草中的有效性不同。这些有效的SSR标记可作为狗尾草遗传相关研究的核心引物。

• 单位
  生命科学学院; 赤峰学院