2019—2021年深圳地区诺如病毒暴发分子流行特征

作者：张海龙; 孟君; 朱曦; 陈龙; 姚相杰; 韦杏燕; 杨艳辉; 杨洪; 旷翠萍; 靳淼^*; 何雅青^*

来源：国际病毒学杂志, 2023, 30(01): 10-15.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2022.01.003-1

• 诺如病毒
• 暴发监测
• 基因型
• 基因组分析

目的了解深圳地区2019—2021年诺如病毒暴发分子流行特征。方法收集2019年1月至2021年12月诺如病毒暴发信息及标本, 应用实时荧光反转录聚合酶链式反应样本进行诺如病毒检测, 阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;对其中3株GII.2[P16]进行基因组扩增和序列分析。结果 2019年1月至2021年12月, 共报告诺如病毒暴发246起, 主要发生在幼儿园(132, 53.66%)和小学(52, 21.14%)。每起暴发发病数范围为3～130, 中位数为8。每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰。211起暴发分型成功, GI和GII分别检出7种和11种基因型, 78起(36.97%)诺如病毒暴发由GII.2[P16]引起。对GII.2[P16]基因组分析表明, 深圳2020年暴发株仍属于GII.2[P16](2016-2017)亚群, 在非结构蛋白P22(L777S)和3C蛋白酶(A1047V和P1074T)上出现氨基酸变异。结论 GII.2[P16]是2019年1月至2021年12月引起深圳市诺如病毒暴发的流行株, 主要发生在学校和幼儿园, 持续监测和基因组分析有助于发现流行株的变异和新毒株的出现。

• 单位
  公共卫生学院; 深圳市罗湖区疾病预防控制中心; 深圳市疾病预防控制中心; 中山大学; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所