人DDB2基因及蛋白质的生物信息学分析

作者：王淮; 杨健康^*

来源：楚雄师范学院学报, 2020, 35(03): 74-80.

• DDB2
• 启动子区
• 蛋白
• 生物信息学

分析DNA损伤特异结合蛋白2(DDB2)基因的启动子、CpG岛、转录因子结合位点、基因表达情况;分析DDB2蛋白的理化性质、同源性、亚细胞定位、信号肽和跨膜区域、蛋白质结构及相互作用网络。DDB2基因至少含有2个启动子。启动子区存在2个CpG岛,长度分别109 bp和267 bp,而且至少包含NF-1和Sp1两个转录因子结合位点。DDB2基因在人体正常组织中均有表达,在白血病早幼粒细胞HL-60、721B淋巴母细胞中表达最高。DDB2蛋白是由427个氨基酸组成的无信号肽、无跨膜区域的亲水蛋白。主要定位于细胞核,二级结构以随机卷曲为主。还发现蛋白DDB1、CUL4A、CUL4B、XPA、COPS2、COPS4、COPS8、COPS5、COPS7B、TP53可能与DDB2存在相互作用。生物信息学对于基因及蛋白质研究具有重要作用。本文通过生物信息学的方法对DDB2基因及蛋白质进行分析,为DDB2的实验研究提供理论基础和新的线索。

• 单位
  大理大学; 基础医学院