不同植物防御素的生物信息学分析

作者：王汉屏

来源：Plant Physiology Communications, 2008, (01): 25-32.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2008.01.020

• 植物防御素
• 生物信息学 phytodefensin
• bioinformatics

采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的花生、鹰嘴豆、合欢、车前草、沙梨、辣椒等植物的防御素的核酸和氨基酸序列作了分析,并对其组成成分、翻译后修饰、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和功能结构域进行预测和推断的结果表明:此类蛋白可能是一具有信号肽的分泌型蛋白,α-螺旋和不规则卷曲是蛋白质二级结构中量最大的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,包含一个gamma-thionin功能结构域。