原儿茶酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合

作者：洪鑫月; 周智圣; 杨晨曦; 黄德辉; 杨春华; 梁恩霞; 张国文

来源：南昌大学学报(理科版), 2019, 43(04): 346-350+358.

DOI：10.13764/j.cnki.ncdl.2019.04.008

• 原儿茶酸
• 小牛胸腺DNA
• 沟槽结合
• 分子模拟

利用荧光光谱法和分子模拟技术,并结合DNA单双链、盐效应、熔点和粘度测量等实验,研究了生理酸度条件下(pH7.4)原儿茶酸与小牛胸腺DNA(ctDNA)的结合性质和结合模式。结果表明,ctDNA能够结合原儿茶酸,并通过静态方式猝灭原儿茶酸的内源荧光,两者的结合常数在103 L·mol-1数量级,氢键和疏水作用是原儿茶酸与ctDNA结合的主要驱动力。原儿茶酸的加入没有明显改变ctDNA的熔点和粘度,单链ctDNA猝灭原儿茶酸荧光的能力大于双链ctDNA,并且NaCl浓度的增加对原儿茶酸-ctDNA复合物的荧光强度没有明显的影响,表明原儿茶酸与ctDNA主要通过沟槽模式结合。分子模拟显示原儿茶酸的结合位点在ctDNA的小沟区,且与碱基胸腺嘧啶(T)形成氢键。分子模拟结果进一步确证了二者之间的沟槽作用模式。

• 单位
  南昌大学食品科学与技术国家重点实验室