龙眼HD-Zip家族固有无序蛋白的预测与分析

作者：张春渝; 许小琼; 张梓浩; 陈裕坤; 林玉玲; 赖钟雄^*

来源：园艺与种苗, 2020, 40(05): 3-7.

DOI：10.16530/j.cnki.cn21-1574/s.2020.05.002

• 固有无序蛋白
• 龙眼HD-Zip
• 氨基酸偏好性
• 应激胁迫
• 分子调控

[目的]探究龙眼HD-Zip中是否存在固有无序蛋白(intrinsically disordered protein,IDPs)。[方法]以龙眼基因组数据库提取的19个龙眼HD-Zip家族成员为对象进行固有无序蛋白的预测、无序区特征以及无序区与有序区的氨基酸偏好性分析。[结果]龙眼HD-Zip的19个成员中共有15个成员为部分无序的固有无序蛋白;龙眼HD-Zip固有无序蛋白的无序区中含有蛋白质的结合位点;20种氨基酸对无序区域以及有序区域的形成各有所偏向。[结论]龙眼HD-Zip固有无序蛋白可能通过分子调控网络参与应激反应;龙眼HD-Zip固有无序蛋白具有氨基酸偏好性。最后,还对人工智能(AI,Artificial Intelligence)在无序蛋白发展的应用前景进行了展望。

• 单位
  福建农林大学