2株新型冠状病毒全基因测序及插入和终止突变分析

作者：韩淑琪

来源：预防医学论坛, 2022, 28(05): 330-334.

DOI：10.16406/j.pmt.issn.1672-9153.2022.05.004

• 新型冠状病毒
• 全基因组测序
• 突变
• 非结构蛋白3
• 开放读码框8

目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术，对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状病毒全基因序列，与Wuhan-Hu-1株基因序列同源性分别为99.96%和99.97%。两条序列的N蛋白均发生S194L变异，N蛋白S194磷酸化位点和N192潜在糖基化位点消失。其中序列1的3 647～3 648 bp之间插入了CCCAC序列，导致非结构蛋白3(NSP3)发生移码突变，即编码一种新的无跨膜结构、含有完整泛素样结构域的NSP3Δ蛋白。序列2发生了C27978T突变，导致开放读码框8(ORF8)发生终止突变，即编码1个新的仅含28个氨基酸的截短型ORF8蛋白。结论 新型冠状病毒进化变异方式复杂多样，插入突变和终止突变可能改变相关蛋白的结构和性质，应加大新型冠状病毒的病原学监测力度。

• 单位
  济宁市疾病预防控制中心