人胚胎肾细胞系HEK293中的翻译调控

作者：柳满; 任悦; 高玉风; 王芳; 余佳

来源：基础医学与临床, 2021, 41(5): 630-635.

DOI：10.3969/j.issn.1001-6325.2021.05.002

• 人胚胎肾细胞系293
• Polysome profiling
• RNA结合蛋白
• 免疫共沉淀

目的 探讨人胚胎肾细胞系HEK293中的翻译调控.方法 通过Polysome profiling结合Western blot实验检测并验证HEK293细胞中mRNA的翻译活性;通过针对RPL10A和RPS17两种核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀、建库测序(RIP-seq)及生物信息学分析,获得参与HEK293细胞蛋白质合成调控的相关分子.结果 在两种核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀实验富集的分子中共有129种基因,其中93.8％ 为蛋白质编码基因;且功能与RNA剪接、分解代谢、MAPK信号通路、染色体定位、RNA转运等相关.结论 通过针对核糖体蛋白的RNA免疫共沉淀可以获得HEK293细胞中活跃翻译的mRNA.

• 单位
  中国医学科学院基础医学研究所; 北京协和医学院; 医学分子生物学国家重点实验室